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    NovelBrain?单细胞测序实验&数据分析培训班第一期圆满落幕 时间:2020-01-07

    2019年1216 -20日,NovelBrain®单细胞测序实验&数据分析培训班第一期开班授课。本期学员分别来自上海、北京、南京、山西、江西等地的各大高校、科研院所及各附属医院,包括中科院生物物理所、中科院上海生命科学研究院、北京航空航天大学、海军军医大学、上海交通大学医学院、九江学院等科研院所以及上海市第一人民医院、上海市第十人民医院、瑞金医院、长海医院、中山医院、长征医院、仁济医院、新华医院、宣武医院、东方肝胆外科医院、北京天坛医院、山西白求恩医院、南京鼓楼医院等附属医院。


    本次课程由烈冰讲师“天团”进行授课:技术总监张博、项目总监洪艳艳、生信主任郭云雷齐上阵,向学员讲授单细胞测序实验&数据分析,包括:单细胞测序研究进展及细胞捕获原理介绍、测序数据分析策略解读、单细胞测序原始数据预处理、分析平台实践上机操作及结果文件解读、分析结果图形化展示以及单细胞悬液制备和捕获实验操作等。



    培训内容:


    单细胞测序研究进展及细胞捕获原理

    l  单细胞测序研究进展;

    l  两大主流平台10×BD单细胞捕获原理;

    l  10×BD单细胞捕获的优缺点;

    l  10×BD建库方法;

    l  TCR、BCR、靶向测序、Ab-Seq等技术相关知识介绍;

    单细胞测序实验设计及案例分析

    l  单细胞测序经典文献解读——肿瘤;

    l  单细胞测序经典文献解读——神经;

    单细胞测序原始数据预处理

    l  10×BD下机原始数据结构讲解;

    l  10×BD 不同平台的数据预处理策略;

    l  细胞数量判断;

    l  数据质量评估;

    l  数据标准化;

    单细胞测序数据分析策略

    l  单细胞测序数据分析流程,包括细胞类型鉴定、拟时序分析、SCENIC分析、CellPhone、inferCNV等等;

    l  单细胞数据分析涉及的相关生物信息学算法和数据库的介绍和选择;

    单细胞云平台介绍及上机实践操作

    l  单细胞云平台功能??榻樯?,包括项目管理、工作流搭建、数据进程监控、结果报告和单细胞浏览器等;

    l  单细胞云平台实际操作,包括新建项目、上传数据、搭建Pipeline、数据分析;

    单细胞数据分析结果图形化展示

    l  如何通过云平台获得可供SCI发表的图形化结果

    单细胞结果解读及参数调试

    l  单细胞数据分析结果文件解读;

    l  Task参数在单细胞数据分析中的重要性

    单细胞测序实验注意事项

    l  单细胞测序实验基本流程;

    l  单细胞悬液制备注意事项;

    单细胞悬液制备和捕获实验操作

    l  小鼠来源样本单细胞悬液制备;

    l  WTA/Ab-Seq实验演示;


    每天课程结束,烈小冰都会收集整理学员的反馈意见,针对学员提出的问题和意见及时对课程进行调整和完善,保证学员可以在高强度课程中吸收重点内容,让每位学员听得懂、记得住、做得会、玩得转单细胞测序~



    为了使学员们能有足够的能量应对高强度的学习压力,烈小冰悉心准备了丰富的饮品零食、水果,还有丰盛的午饭,为大家创造更好的培训环境。


    课程结束之后,学员进公司参观,并获得本次培训班的结课荣誉证书,以鼓励各位学员认真的学习态度。


    错过第一期培训的老师不要着急,烈冰单细胞测序&数据分析培训班第二期正在加紧筹划中~  2020年,烈小冰与您不见不散!




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